Un des effets les mieux connus de la présence des microorganismes dans nos aliments est la dégradation de la qualité. Cette dernière au plan microbiologique peut être définie de deux façon : la qualité hygiénique en relation avec la propreté et la santé et la qualité marchande qui concerne essentiellement les caractéristiques organoleptiques des aliments et qui se traduit par un attrait ou une répugnance des consommateurs. Cette qualité est aussi déterminante pour l’industrie alimentaire.